R语言 flowMeans包 flowMeans()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

flowMeans(flowMeans)
flowMeans()所属R语言包：flowMeans

                                        flowMeans
                                         flowMeans

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Finds a good fit to the data using k-means clustering algorithm. Then merges the adjacent dense spherical clusters to find non-spherical clusters.
使用k-means聚类算法的数据发现一个不错的选择。然后合并相邻的致密的球形聚类找到非球面聚类。


用法----------Usage----------


flowMeans(x, varNames=NULL, MaxN = NA, NumC = NA, iter.max = 50, nstart = 10,
Mahalanobis = TRUE, Standardize = TRUE, Update = "Mahalanobis", OrthagonalResiduals=TRUE,
MaxCovN=NA, MaxKernN=NA, addNoise=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：x
A matrix, data frame of observations, or object of class flowFrame.  Rows correspond to observations and columns correspond to variables.
一个矩阵，观测的数据框，或对象类flowFrame。行对应到的意见和列对应至变数。


参数：varNames
A character vector specifying the variables (columns) to be included in clustering.  When it is left unspecified, all the variables will be used.
指定一个字符向量聚类变量（列）。当它被指定，将使用所有的变量。


参数：MaxN
Maximum number of clusters. If set to NA (default) the value will be estimated automatically.  
聚类的最大数量。如果设置为NA（默认）自动将估计值。


参数：NumC
Number of clusters. If set to NA (default) the value will be estimated automatically.  
簇的数目。如果设置为NA（默认）自动将估计值。


参数：iter.max
The maximum number of iterations allowed.  
允许的最大迭代数。


参数：nstart
The number of random sets used for initialization.  
用于初始化随机台数。


参数：Mahalanobis
Boolean value. If TRUE (default) mahalanobis distance will be used. Otherwised, euclidean distance will be used.   
布尔值。如果将使用True（默认）马氏距离。 otherwised，将使用欧氏距离。


参数：Standardize
Boolean value. If TRUE (default) the data will be transformed to the [0,1] interval.   
布尔值。如果为TRUE（默认）的数据将被转换为[0,1]区间。


参数：Update
String value. If set to "Mahalanobis" the distance function will be updated at each merging iteration with recalculating mahalanobis distances. If set to "Mean" the distance matrix will be updated after each merging step with averaging. If set to "None" the distance matrix will not be updated.   
字符串值。如果设置为“马氏”的距离函数将在每个合并重新计算马氏距离的迭代更新。如果设置为“中庸”的距离矩阵将被更新后，每个平均合并的步骤。如果设置为“无”的距离矩阵将不会被更新。


参数：MaxCovN
Maximum number of points, used for calculating the covariance. If set to NA (default), all the points will be used.)  
点的最大数量，用于计算协方差。如果设置为NA（默认），将用于所有点。）


参数：MaxKernN
Maximum number of points, used for counting the modes using kernel density estimation. If set to NA (default), all the points will be used.)  
点的最大数量，用于计数模式，使用内核密度估计。如果设置为NA（默认），将用于所有点。）


参数：addNoise
Boolean value. Determines if uniform noise must be added to the data to prevent singularity issues or not.   
布尔值。如果必须添加均匀噪声的数据，以防止奇异性问题或不确定。


参数：OrthagonalResiduals
Boolean value, indicates if the residuals must be transformed to orthagonal distance or not.  
布尔值，表示如果残差必须转化为orthagonal距离或不。


Details

详情----------Details----------

If Mahalanobis distance is not used (i.e., Mahalanobis=FALSE) then the Update value cannot be set to Mahalanobis (i.e., Update="Mahalanobis")
如果不使用马氏距离（即马氏= FALSE）然后更新值不能被设置为马氏（即更新=“马氏”）


值----------Value----------


参数：Label
A vector of integers indicating the cluster to which each point is allocated.   
一个整数表示每个点被分配到聚类的向量。


参数：Labels
A list of vectors of integers indicating the cluster to which each point is allocated at each merging iteration.   
指示聚类的整数向量的列表，每个点被分配在每个合并的迭代。


参数：Mats
A list of distance matrixes between clusters at every merging iteration.  
在每一个合并的迭代簇之间的距离矩阵列表。


参数：MaxN
Maximum number of clusters  
聚类的最大数量


参数：Mins
A vector of integers indicating the distance between the two clusters chosen to be merged at every iteration.  
整数表示，选择在每次迭代合并两个簇之间的距离向量。


参数：MinIndex
Index of the merging step that produced the final results.  
指数合并的步骤产生的最终结果。


参数：Line1
First regression line used for finding the changepoint for stopping the merging process.  
第一回归线用于寻找停止合并过程中的变点。


参数：Line2
Second regression line used for finding the changepoint for stopping the merging process.  
二回归线用于寻找停止合并过程中的变点。


作者（S）----------Author(s)----------



Nima Aghaeepour




举例----------Examples----------


library(flowMeans)
data(x)
res <- flowMeans(x, c("FL1.H", "FL2.H", "FL3.H", "FL4.H"), MaxN=10)
plot(x[,c(3,4)], res, c("FL1.H", "FL2.H"))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。