R语言 flowFlowJo包 flowFlowJo-package()函数中文帮助文档(中英文对照)

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flowFlowJo-package(flowFlowJo)
flowFlowJo-package()所属R语言包：flowFlowJo

                                         Turn FlowJo workspaces into flowCore compliant objects
                                         打开FlowJo成flowCore兼容对象的工作区

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract information, gates, FCS file (locations) etc. from a FlowJo workspace
提取信息，闸门，FCS（处）等文件从FlowJo工作区


Details

详情----------Details----------

FlowJo is a commercially available software package used in gating and analyzing data from flow cytometry experiments.  Upon saving, FlowJo produces an XML format file that contains all the information necessary to describe the gating structures, compensation, transformation, location of the FCS files, and opened graphs and figures last created by the user.  This package (flowFlowJo) is a small set of methods designed to extract the file locations, gates, compensation matrices and other meta-data contained in FlowJo workspaces and return the information in a manner consistent with the BioConductor flowCore packages.
FlowJo是市售的门和流式单元仪实验数据分析软件包。在节能，FlowJo产生一个XML格式的文件，它包含所有必要的信息来形容门结构，补偿，改造，FCS的文件的位置，打开最后由用户创建的图表和数字。这个包（flowFlowJo）是一套设计方法，提取文件的位置，大门，补偿矩阵和FlowJo工作区中的其他元数据，并返回信息的方式一致与BioConductor flowCore包小。


注意----------Note----------

See a complete discussion with examples via: vignette("flowFlowJo")
看到通过完整讨论的例子：小插曲（“flowFlowJo”）


作者（S）----------Author(s)----------



John Gosink
<gosinkj@amgen.com>




举例----------Examples----------



# A demo set of FCS files and attendant FlowJo workspace are included with[FCS的文件以及随之而来的FlowJo工作区的一个演示一套包含]
# this package.  This extracts the info from the workspace.[这个软件包。这从工作区中提取信息。]

library(flowFlowJo);
demoLocation <- system.file("extdata", "DemoWorkspace.wsp", package="flowFlowJo");
actualFCSLoc <- system.file("extdata/fcsFiles", package="flowFlowJo");
testList     <- readFlowJoList(demoLocation, altFileLocation=actualFCSLoc);
z            <- getFlowJoGates(testList, fileNamePatterns=c("C02"));

# Take a look at z.  It contains the name(s), location(s), compensation matrix, gate/filter(s) [采取在z。它包含名称（S）（S），位置，补偿矩阵，门/过滤器（S）]
# and gate/filter names for one of the FCS files referenced in the workspace.[门/过滤器的名称为在工作区中所引用的FCS文件之一。]


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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