INI_Calls-class(farms)
INI_Calls-class()所属R语言包:farms
Class INI_Calls
类INI_Calls
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is a class representation for an INI_calls-class object. The INI_calls-class consists of two instances of exprSet-class, containing an informative exprSet and a non-informative exprSet.
这是一个INI_calls-class对象类表示。 INI_calls-class两个exprSet-class实例,包含的信息exprSet和非信息exprSet。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects can be created using the function INIcalls.
创建对象可以使用的功能INIcalls。
插槽----------Slots----------
I_Calls: Object of class "vector" containing informative probe set names.
I_Calls类"vector"包含的信息探针集名称的对象。
NI_Calls: Object of class "vector" containing non-informative probe set names.
NI_Calls类"vector"含非信息探针集名称的对象。
I_Exprs: Object of class exprSet-class representing the informative exprSet.
I_Exprs:Object类的exprSet-class代表的信息exprSet。
NI_Exprs: Object of class exprSet-class representing the non-informative exprSet.
NI_Exprs:Object类的exprSet-class代表非信息exprSet。
varZX: Object of class "vector" containing the INI-call value.
varZX类"vector"包含的INI调用值的对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Djork Clevert
参见----------See Also----------
expFarms, qFarms,lFarms,INIcalls
expFarms,qFarms,lFarms,INIcalls
举例----------Examples----------
data(testAffyBatch)
eset <- expFarms(testAffyBatch, bgcorrect.method = "none", pmcorrect.method = "pmonly", normalize.method = "constant")
INIs <- INIcalls(eset) # apply I/NI calls[申请的I /倪通话]
summary(INIs)
plot(INIs) # draws a density plot of I/NI-calls[我/倪调用绘制密度图]
I_data <- getI_Eset(INIs) # affybatch containing only informative probe sets[affybatch包含只有翔实的探针组]
NI_data <- getNI_Eset(INIs) # affybatch containing only non-informative probe sets[affybatch含有唯一的非翔实的探针组]
I_probes <- getI_ProbeSets(INIs) # vector containing only informative probe sets names[向量,只有翔实探针设置名称]
NI_probes <- getNI_ProbeSets(INIs) # vector containing only non-informative probe sets names[向量,只有非翔实的探针设置名称]
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