R语言 farms包 INIcalls-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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INIcalls-methods(farms)
INIcalls-methods()所属R语言包：farms

                                        Dimension reduction based on informative genes
                                         基于翔实基因的降维对

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function generates an  instance of INI_Calls-class of given  which has been summarized by expFarms, qFarms or lFarms before, based on the informative genes.
这个函数生成一个实例INI_Calls-class已expFarms总结，qFarms或lFarms之前，基于对信息的基因。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'ExpressionSet'
INIcalls(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
An instance of exprSet-class.
exprSet-class实例。


值----------Value----------

exprSet-class
exprSet-class


方法----------Methods----------




signature(object = "ExpressionSet") An instance of exprSet-class.
signature(object = "ExpressionSet")exprSet-class的实例。


参见----------See Also----------

expFarms, qFarms,lFarms,INIcalls
expFarms，qFarms，lFarms，INIcalls


举例----------Examples----------


data(testAffyBatch)
eset <- expFarms(testAffyBatch, bgcorrect.method = "rma", pmcorrect.method = "pmonly", normalize.method = "constant")
INIs &lt;- INIcalls(eset)  # apply I/NI calls[申请的I /倪通话]
summary(INIs)
plot(INIs) # draws a density plot of I/NI-calls[我/倪调用绘制密度图]
I_data &lt;- getI_Eset(INIs) # affybatch containing only informative probe sets[affybatch包含只有翔实的探针组]
NI_data &lt;- getNI_Eset(INIs) # affybatch containing only non-informative probe sets[affybatch含有唯一的非翔实的探针组]
I_probes &lt;- getI_ProbeSets(INIs) # vector containing only informative probe sets names[向量，只有翔实探针设置名称]
NI_probes &lt;- getNI_ProbeSets(INIs) # vector containing only  non-informative probe sets names[向量，只有非翔实的探针设置名称]

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