R语言 fabia包 plotBicluster()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotBicluster(fabia)
plotBicluster()所属R语言包：fabia

                                        Plotting of a bicluster
                                         标图1 bicluster的

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plotBicluster: R implementation of  plotBicluster.
plotBicluster：R的plotBicluster实施。


用法----------Usage----------



plotBicluster(r,p,opp=FALSE,zlim=NULL,title=NULL,which=c(1, 2))






参数----------Arguments----------

参数：r
the result of extract_bic.
结果的extract_bic。


参数：p
the bicluster to plot.  
绘制的bicluster。


参数：opp
plot opposite bicluster, default = FALSE.
图对面bicluster，默认为FALSE。


参数：zlim
vector containing a low and high value to use for the color scale.
使用色阶低和高价值的向量。


参数：title
title of the plot.
图的标题。


参数：which
which plots are shown: 1=data matrix with bicluster on upper left, 2=plot of the bicluster; default c(1, 2).
图所示：1 =数据矩阵与bicluster左上角，2 =积的bicluster的;默认C（1，2）。


Details

详情----------Details----------

One bicluster is visualized by two plots. The variable "which" indicates which plots should be shown.
可视化一个bicluster是由两个图。变量“”表示应显示哪些图。

Plot1 (which=1): The data matrix is sorted such that the bicluster appear at the upper left corner. The bicluster is marked by a rectangle.
数据plot1（其中= 1）：矩阵排序等，bicluster出现在左上角。 bicluster是由一个长方形标记。

Plot2 (which=2): Only the bicluster is plotted.
plot2（其中= 2）：只有bicluster绘制。

Implementation in R.
R中的实现


作者（S）----------Author(s)----------


Sepp Hochreiter



参见----------See Also----------

fabia, fabias, fabiap, fabi, fabiasp, mfsc, nmfdiv, nmfeu, nmfsc, plot, extractPlot, extractBic, plotBicluster, Factorization, projFuncPos, projFunc, estimateMode, makeFabiaData, makeFabiaDataBlocks, makeFabiaDataPos, makeFabiaDataBlocksPos, matrixImagePlot, summary, show, showSelected, fabiaDemo, fabiaVersion
fabia，fabias，fabiap，fabi，fabiasp，mfsc，nmfdiv，nmfeu，nmfsc，plot，extractPlot，extractBic，plotBicluster，Factorization，projFuncPos，projFunc，estimateMode ，makeFabiaData，makeFabiaDataBlocks，makeFabiaDataPos，makeFabiaDataBlocksPos，matrixImagePlot，summary，show，showSelected fabiaDemo，fabiaVersion


举例----------Examples----------



#---------------[---------------]
# TEST[试验]
#---------------[---------------]

dat <- makeFabiaDataBlocks(n = 100,l= 50,p = 3,f1 = 5,f2 = 5,
  of1 = 5,of2 = 10,sd_noise = 3.0,sd_z_noise = 0.2,mean_z = 2.0,
  sd_z = 1.0,sd_l_noise = 0.2,mean_l = 3.0,sd_l = 1.0)

X <- dat[[1]]
Y <- dat[[2]]


resEx <- fabia(X,3,0.01,20)

rEx <- extractBic(resEx)

plotBicluster(rEx,p=1)


## Not run: [＃无法运行：]
#---------------[---------------]
# DEMO1[DEMO1]
#---------------[---------------]

dat <- makeFabiaDataBlocks(n = 1000,l= 100,p = 10,f1 = 5,f2 = 5,
  of1 = 5,of2 = 10,sd_noise = 3.0,sd_z_noise = 0.2,mean_z = 2.0,
  sd_z = 1.0,sd_l_noise = 0.2,mean_l = 3.0,sd_l = 1.0)

X <- dat[[1]]
Y <- dat[[2]]


resToy <- fabia(X,13,0.01,200)



rToy <- extractBic(resToy)

plotBicluster(rToy,p=1)

#---------------[---------------]
# DEMO2[DEMO2]
#---------------[---------------]

avail <- require(fabiaData)

if (!avail) {
    message("")
    message("")
    message("#####################################################")[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃ ＃＃“）]
    message("Package 'fabiaData' is not available: please install.")
    message("#####################################################")[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃ ＃＃“）]
} else {

data(Breast_A)

X <- as.matrix(XBreast)

resBreast <- fabia(X,5,0.1,200)

rBreast <- extractBic(resBreast)

plotBicluster(rBreast,p=1)

}


## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。