ExpressionView-package(ExpressionView)
ExpressionView-package()所属R语言包：ExpressionView
The ExpressionView package
ExpressionView包
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A package designed to interactively explore biclusters identified in gene expression data.
以交互方式探索在基因表达数据确定biclusters设计一个包。
介绍----------Introduction----------
Clustering genes according to their expression profiles is an important task in analyzing microarray data. ExpressionView allows the user to explore the biclusters together with the underlying data in an interactive environment. The applet requires a browser with Adobe Flash player 10 installed.
聚类根据自己的表达谱基因芯片数据分析的一个重要任务。 ExpressionView允许用户共同探讨在一个互动的环境基础数据的biclusters。在applet需要安装浏览器使用Adobe Flash Player 10。
The ExpressionView package can treat gene expression data in the form of a Bioconductor ExpressionSet. It recognizes biclusters identified by the Iterative Signature Algorithm (ISA) implemented in the ISA package as well as the methods available in the biclust package.
ExpressionView包1的BioconductorExpressionSet的形式可以治疗基因表达数据。它承认迭代签名算法在ISA包（ISA）的实施以及biclust包中可用的方法，确定biclusters。
worflow----------Worflow----------
The usual workflow consist of three steps:
通常的工作流程包括三个步骤：
To arrange the possibly overlapping biclusters in a visually appealing layout, the gene expression data has to be reordered in such a way that individual biclusters from contiguous rectangles. The
要安排在视觉上吸引人的布局可能重叠biclusters的，基因表达数据必须以这样一种方式重新排序，从个人biclusters连续矩形。 “
Export In a second step, the biclusters and all the relevant biological information are combined and exported to an ExpressionView
出口在第二个步骤，biclusters和所有相关的生物信息相结合，并远销到ExpressionView
The Flash applet is started by the LaunchEV command. Video tutorials describing the various features of the applet can be found on the ExpressionView website (http://www.unil.ch/cbg/ExpressionView).
LaunchEV命令开始的Flash小程序。视频教程描述的各种功能的小程序，可以发现对ExpressionView网站（http://www.unil.ch/cbg/ExpressionView）。
A tutorial can be found in the accompanying vignette of the package.
一个教程，可以发现在包随附的小插曲。
与非基因表达数据的双聚类----------Biclustering with non-gene expression data----------
Both, the ISA and the biclustering methods implemented in the biclust package can treat any two-dimensional data, i.e., not necessarily originating from gene expression profiling. While the ExpressionView package is optimized for gene expression matrices, it is also possible to explore data stemming from other sources. For more information, see the description of the ExportEV function.
，ISA和biclust包实施的双聚类方法可以处理任何二维的数据，也就是说，不一定源于基因表达谱。 ，而ExpressionView包优化基因表达矩阵，它也可以探索从其他来源产生的数据。有关详细信息，请参阅ExportEV函数的描述。
作者（S）----------Author(s)----------
Andreas L黶cher
<a href="mailto:andreas.luescher@a3.epfl.ch">andreas.luescher@a3.epfl.ch</a>
参见----------See Also----------
OrderEV, ExportEV and
OrderEV，ExportEV“
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-2-25 17:23:58
