R语言 ExiMiR包 ReadExi()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ReadExi(ExiMiR)
ReadExi()所属R语言包：ExiMiR

                                         Exiqon 'txt' files reader
                                         exiqontxt的文件阅读器

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function reads Exiqon 'txt' files and create an AffyBatch object.
此功能读取的Exiqon“TXT”文件，并创建一个AffyBatch对象。


用法----------Usage----------


ReadExi(        txtfile.path= getwd(),
                        galname= NULL,
                        description = NULL,
                        notes = '',
                        rm.background = FALSE,
                        verbose=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：txtfile.path
Character vector. Path to the folder which contains samplesinfo.txt and Exiqon 'txt' files  
特征向量。其中包含samplesinfo.txt Exiqon“TXT”文件的文件夹路径


参数：galname
Character vector. Name of a GAL environment generated by the ExiMiR make.gal.env function.  
特征向量。名称的ExiMiR make.gal.env函数生成一个GAL环境。


参数：description
a MIAME object.  
MIAME对象。


参数：notes
notes.  
笔记。


参数：rm.background
Logical. Default value is FALSE. If TRUE, the background median is subtracted from the signal median.  
逻辑。默认值是FALSE。如果TRUE，从信号中位数减去背景中位数。


参数：verbose
Logical. Default value is TRUE; some details are provided on the console  
逻辑。默认值为TRUE;一些细节上提供的控制台


Details

详情----------Details----------

Exiqon 'txt' files are supplied with a samplesinfo.txt description file which lists the names of the samples files per channel. The txtfile.path argument should be a folder that contains 'txt' files and a samplesinfo.txt file. If not, the ReadExi function stops. The galname argument should be the name of the GAL environment created with make.gal.env function. If galname is not provided, an hashed environment is  created based on the annotation that the 'txt' file contains.
exiqontxt的文件提供了samplesinfo.txt描述文件，其中列出了每个通道的样本文件名称。 txtfile.path参数应该是一个包含txt的文件和samplesinfo.txt文件夹。如果没有，ReadExi功能停止。 galname参数应该是创建的GAL环境make.gal.env函数的名称。 galname如果不提供，哈希环境创建的基础上的“TXT”文件中包含的注解。


值----------Value----------

An AffyBatch object.
AffyBatch对象。


警告----------Warning----------

The image method from the AffyBatch object might not work properly when the galname argument is not assigned.
imageAffyBatch对象的方法可能无法正常工作时galname参数没有被分配。


作者（S）----------Author(s)----------



Sylvain Gubian, Alain Sewer, PMP SA




参见----------See Also----------

AffyBatch, make.gal.env
AffyBatch，make.gal.env


举例----------Examples----------


        # The folder 'Exiqon' contains the file 'samplesinfo.txt' and [文件夹“Exiqon”包含文件“samplesinfo.txt]
        # the corresponding raw data files in TXT format[相应的原始数据文件，TXT格式]
        ## Not run: ebatch &lt;- ReadExi(txtfile.path='Exiqon')[＃无法运行：ebatch < -  ReadExi（txtfile.path =Exiqon）]
        # If the GAL environment has already created by the function make.gal.env[如果GAL环境已经创建功能make.gal.env]
        ## Not run: ebatch &lt;- ReadExi(galenv='galenv, 'txtfile.path='Exiqon')[＃无法运行：ebatch < -  ReadExi（galenv =galenv，“txtfile.path =Exiqon）]

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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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