readDGE(edgeR)
readDGE()所属R语言包：edgeR
Read and Merge a Set of Files Containing DGE Data
读取合并含胃排空数据文件的设置
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Reads and merges a set of text files containing digital gene expression data.
读取和合并了一套包含数字基因表达数据的文本文件。
用法----------Usage----------
readDGE(files, path=NULL, columns=c(1,2), group=NULL, labels=NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数：files
character vector of filenames, or alternatively a data.frame with a column containing the file names of the files containing the libraries of counts and, optionally, columns containing the group to which each library belongs, descriptions of the other samples and other information.
特征向量的文件名，或者一个数据框包含的文件的文件名包含计数的图书馆，并选择性地列包含每个库所属group，其他样本的描述和列其他信息。
参数：path
character string giving the directory containing the files. The default is the current working directory.
字符串，包含文件的目录。默认为当前工作目录。
参数：columns
numeric vector stating which two columns contain the tag names and counts, respectively
数字向量，说明两列包含的标记名称和数量，分别
参数：group
vector, or preferably a factor, indicating the experimental group to which each library belongs. If group is not NULL, then this argument overrides any group information included in the files argument.
向量，或最好的一个因素，这表明实验组，每个库属于。 group如果非NULL，那么这个参数将覆盖任何组的信息，包括files参数。
参数：labels
character vector giving short names to associate with the libraries. Defaults to the file names.
短名称与库关联的特征向量。默认文件名。
参数：...
other are passed to read.delim
其他被传递read.delim的
Details
详情----------Details----------
Each file is assumed to contained digital gene expression data for one sample (or library), with transcript identifiers in the first column and counts in the second column. Transcript identifiers are assumed to be unique and not repeated in any one file. By default, the files are assumed to be tab-delimited and to contain column headings. The function forms the union of all transcripts and creates one big table with zeros where necessary.
假定每个文件中包含一个样本的数字基因表达数据（库），在第一列和第二列计数的成绩单标识符。成绩单标识符被认为是独特的，在任何一个文件，不重复。默认情况下，文件被认为是制表符分隔的，包含列标题。功能形成的工会所有成绩单和零在必要时创建的一个大表。
值----------Value----------
DGEList object
DGEList对象
作者（S）----------Author(s)----------
Mark Robinson and Gordon Smyth
参见----------See Also----------
DGEList provides more information about the DGEList class and the function DGEList, which can also be used to construct a DGEList object, if readDGE is not required to read in and construct a table of counts from separate files.
DGEList提供了更多的DGEList有关DGEList类和函数的DGEList，这也可以用来构建一个readDGE对象的信息，如果不需要阅读和建立一个单独的文件中的计数表。
举例----------Examples----------
# Read all .txt files from current working directory[从当前工作目录的所有txt文件阅读]
## Not run: files <- dir(pattern="*\\.txt$")[＃无法运行：< - 目录文件（模式=“* \ \ TXT $”）]
RG <- readDGE(files)
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 17:09:53
