R语言 edgeR包 DGELRT-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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DGELRT-class(edgeR)
DGELRT-class()所属R语言包：edgeR

                                        Digital Gene Expression Likelihood Ratio Test data and results - class
                                         数字基因表达的似然比检验数据和结果 - 类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A simple list-based class for storing results of a GLM-based differential expression analysis for DGE data, with evidence for differential expression assessed using a likelihood ratio test.
胃排空数据的的GLM基差表达分析结果存储与差异表达的证据，基于一个简单的列表类的评估，使用似然比检验。


角子机/列表组件----------Slots/List Components----------

Objects of this class contain the following list components:
这个类的对象包含以下列表组件：

table: data frame containing the log-concentration (i.e. expression level), the log-fold change in expression between the two groups/conditions and the exact p-value for differential expression, for each tag.
table：数据框包含log浓度（即表达水平），两组/条件和p值差异表达的确切log倍之间在表达变化，每个标签。

coefficients.full: matrix containing the coefficients computed from fitting the full model (fit using glmFit and a given design matrix) to each gene/tag in the dataset.
coefficients.full：包含从装修到DataSet中的每个基因/标签的完整模型（适合使用glmFit和一个给定的设计矩阵）计算的系数矩阵。

coefficients.null: matrix containing the coefficients computed from fitting the null model to each gene/tag in the dataset.  The null model is the model to which the full model is compared, and is fit using glmFit and dropping selected column(s) (i.e. coefficient(s)) from the design matrix for the full model.
coefficients.null：包含DataSet中的每个基因/标签从空模型拟合计算系数矩阵。空模型是模型比较完整的模型，并适合使用glmFit和删除所选列（S）（即系数（S）），从完整的模型设计矩阵。

design: design matrix for the full model from the likelihood ratio test.
design：从似然比检验模型的设计矩阵。

...: if the argument y to glmLRT (which produces the DGELRT object) was itself a DGEList object, then the DGELRT will contain all of the elements of y, except for the table of counts and the table of pseudocounts.
...：如果参数yglmLRT（产生DGELRT对象的），本身就是一个DGEList对象，然后DGELRT将包含所有元素y，计数表和表pseudocounts除外。


方法----------Methods----------

This class inherits directly from class list so any operation appropriate for lists will work on objects of this class. DGELRT objects also have a show method.
这个类直接继承自类list所以适当列表的任何操作，将这个类的对象。 DGELRT对象也有一个show方法。


作者（S）----------Author(s)----------


Davis McCarthy

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注：
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