R语言 edgeR包 betaApproxNBTest()函数中文帮助文档(中英文对照)

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betaApproxNBTest(edgeR)
betaApproxNBTest()所属R语言包：edgeR

                                        An Approximate Exact Test for Differences between Two Negative Binomial Groups
                                         一个近似的精确测试两负二项式群体之间的差异

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Approximate the tail probabilities of a conditional negative binomial exact test of equality of means between groups.
近似的群体之间的平等的条件负二项分布精确检验尾概率。


用法----------Usage----------


betaApproxNBTest(x1, x2, dispersion)



参数----------Arguments----------

参数：x1
vector of observed negative binomial variables for group one
矢量观测组一负二项分布变量


参数：x2
vector of observed negative binomial variables for group two
观测到的负二项式组两个变量的向量


参数：dispersion
vector or scalar providing the value of the NB dispersion parameter for each tag to be used for calculating p-values for differences in mean between the two groups.
每个标签被用于计算p值在两组之间的平均差异为NB分散参数值的向量或标量。


Details

详情----------Details----------

exactTest is the user-level function for computing p-values for differential expression between groups in DGE data. However, for tags with extremely large counts, the computation of the tail propbabilities of the conditional negative binomial exact test can be unstable. For such tags, the tail probabilities are well approximated by using a transformed beta distribution (Anderson and Boullion, 1972).
exactTest是用于计算用户级功能差胃排空数据组之间的表达p-值。然而，对于具有非常大的数量的标签，计算条件负二项分布精确检验的尾巴propbabilities可以是不稳定的。对于这样的标签，尾概率近似使用转化的β分布（安德森和Boullion，1972年）。


值----------Value----------

Vector of p-values providing the extent of evidence for difference in means between the two groups.
矢量提供的证据在两组之间的差异程度的p值。


作者（S）----------Author(s)----------


Davis McCarthy



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

Computing p-values for differential expression for each transcript between two (only) digital gene expression libraries can also be done using the sage.test function in the statmod package.
计算p值差为每间的谈话内容（只）sage.test包statmod函数也可以做数字基因表达库的表达。


举例----------Examples----------


# generate raw counts from NB, create list object[来自NB生成的原始计数，创建列表对象]
x1<-rnbinom(20,size=1,mu=1000)
x2<-rnbinom(20, size=1, mu=1500)
betaApproxNBTest(x1, x2, dispersion=1)

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