R语言 ecolitk包 ecoligenome.operon()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ecoligenome.operon(ecolitk)
ecoligenome.operon()所属R语言包：ecolitk

                                         Known operon in E.coli - data.frame
                                         被称为操纵子在大肠杆菌中的 - 数据框

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The known operon in the Escherichia coli genome.
在大肠埃希氏菌基因组已知的操纵。


用法----------Usage----------


data(ecoligenome.operon)



格式----------Format----------

A data frame with 932 observations (genes) on the following 4 variables.
与932观测数据框（基因）在以下4个变量。




gene.name a character vector
gene.name 1特征向量




gene.annotation a character vector
gene.annotation 1特征向量




operon.name a factor with levels the names of the operons
operon.name 1因子水平的操纵子的名字




operon.comments a factor with levels the comments for the operons
operon.comments与水平因子的操纵子的意见


Details

详情----------Details----------

For some operons, the source of information specifies the existence of regulating elements such as promoter, terminator, box, etc... In those cases, the gene.name is set to "Regulation", and the gene.annotation gives what kind of regulating element it is. If volonteers, it would be neat to map those on the genome... Besides that, not much to add. The data structure is fairly straightforward.
对于一些操纵子，信息源指定的调节，如启动，终止，框等元素的存在。在这些情况下，gene.name设置为"Regulation"，gene.annotation给人什么样的调节元素。如果volonteers，这将是整齐的映射基因组上的...除此之外，没有太大的增加。数据结构是相当简单的。


源----------Source----------

Built from the webpage: http://www.cib.nig.ac.jp/dda/backup/taitoh/ecoli.operon.html
内置网页：http://www.cib.nig.ac.jp/dda/backup/taitoh/ecoli.operon.html


举例----------Examples----------


library(Biobase)
data(ecoligenome.operon)
data(ecoligenomeSYMBOL2AFFY)

## something that might be useful when working with Affymetrix data:[＃与Affymetrix数据时，可能是有用的东西：]
## get the Affymetrix identifiers for the probe sets bundled in operons[＃得到探针的Affymetrix标识符集捆绑在操纵子]
## (see the vignette for more details)[（看到更多细节的小插曲）]
ecoligenome.operon$affyid <-
unname(unlist(mget(ecoligenome.operon$gene.name,
                   ecoligenomeSYMBOL2AFFY, ifnotfound=NA)))


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