R语言 EBImage包 getFeatures()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getFeatures(EBImage)
getFeatures()所属R语言包：EBImage

                                        Extract feature extraction from image objects
                                         从图像对象提取特征提取

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extracts numerical features from image objects.
从图像对象提取的数字特征。


用法----------Usage----------


  getFeatures(x, ref, N=12, R=30, nc=32)



参数----------Arguments----------

参数：x
An Image object or an array containing object masks. Object masks are sets of pixels with the same unique integer value.
Image对象或数组，包含对象口罩。对象口罩套像素具有相同的唯一的整数值。


参数：ref
An Image object or an array, containing the intensity values of the objects.
Image对象或数组，包含对象的强度值。


参数：N
Passed to zernikeMoments. Integer value  defining the degree of the Zernike polynomials, which in turn defines the number of features calculated. Defaults to 12.
传递zernikeMoments。 Integer值，定义Zernike多项式，进而定义计算功能的程度。默认为12。


参数：R
Passed to zernikeMoments. Defines the radius  of the circle around an object centre from which the features are calculated.  See details. Defaults to 30.
传递zernikeMoments。围绕一个中心，从它的特点是计算对象的定义圆的半径。查看详情。默认为30。


参数：nc
Passed to haralickFeatures. A numeric value.  Specifies the number of gray levels to bin ref into when  computing the co-occurrence matrix. Defaults to 32.
传递haralickFeatures。一个数值。斌ref到指定数量级灰度共生矩阵计算时。默认为32。


Details

详情----------Details----------

Combines and returns the features returned by hullFeatures, moments, edgeFeatures, haralickFeatures and zernikeMoments.
结合返回hullFeatures返回的功能，moments，edgeFeatures，haralickFeatures和zernikeMoments。


值----------Value----------

getFeatures returns feature matrices.
getFeatures返回特征矩阵。


作者（S）----------Author(s)----------



Oleg Sklyar, <a href="mailtosklyar@ebi.ac.uk">osklyar@ebi.ac.uk</a>, 2007




参见----------See Also----------

hullFeatures, moments, edgeFeatures haralickFeatures, zernikeMoments
hullFeatures，moments，edgeFeaturesharalickFeatures，zernikeMoments


举例----------Examples----------


  x = readImage(system.file('images', 'nuclei.tif', package='EBImage'))
  x = x[,,1]
  if (interactive()) display(x)

  ## computes object mask[＃计算对象的遮罩]
  y = thresh(x, 10, 10, 0.05)
  y = opening(y, makeBrush(5, shape='disc'))
  mask = bwlabel(y)
  if (interactive()) display(mask, title='Cell nuclei')

  ## features[＃功能]
  ftrs = getFeatures(mask, x)[[1]]
  print(ftrs[1:5,])

  ## paint nuclei with an eccentricity higher than 0.85[＃画原子核比0.85更高的偏心]
  maskb = mask
  id = which(ftrs[,'m.ecc']<0.85)
  maskb[!is.na(match(maskb, id))] = 0

  img = paintObjects(maskb, channel(x, 'rgb'), col='red')
  if (interactive()) display(img, title='Nuclei with high eccentricity')

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