readGeneExp(DEGseq)
readGeneExp()所属R语言包：DEGseq
readGeneExp: read gene expression values to a matrix
readGeneExp：读取基因的表达值矩阵
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This method is used to read gene expression values from a file to a matrix in R workspace. So that the matrix can be used as input of other packages, such as edgeR. The input of the method is a file that contains gene expression values.
此方法用于从一个文件到研发工作区矩阵读取基因的表达值。因此，矩阵可以用于其他的软件包，如磨边，输入。该方法的输入是一个文件，其中包含基因的表达值。
用法----------Usage----------
readGeneExp(file, geneCol=1, valCol=2, label = NULL, header=TRUE, sep="")
参数----------Arguments----------
参数：file
file containing gene expression values.
文件包含基因的表达值。
参数：geneCol
gene id column in file.
文件中的基因ID列。
参数：valCol
expression value columns to be read in the file.
要读取文件中的表达式的值列。
参数：label
label for the columns.
列标签。
参数：header
a logical value indicating whether the file contains the names of the variables as its first line. See ?read.table.
一个逻辑值，指示是否该文件包含的变量的名称作为其第一线。看到?read.table。
参数：sep
the field separator character. If sep = "" (the default for read.table) the separator is white space, that is one or more spaces, tabs, newlines or carriage returns. See ?read.table.
字段分隔符。如果SEP =“（为read.table默认的）分隔是空白，这是一个或多个空格，制表符，换行符或回车。看到?read.table。
参见----------See Also----------
getGeneExp, GeneExpExample1000, GeneExpExample5000.
getGeneExp，GeneExpExample1000，GeneExpExample5000。
举例----------Examples----------
## If the data files are collected in a zip archive, the following[＃如果数据文件被收集在一个zip档案，以下]
## commands will first extract them to the temporary directory.[＃命令首先将它们解压到临时目录。]
geneExpFile <- system.file("extdata", "GeneExpExample1000.txt", package="DEGseq")
exp <- readGeneExp(file=geneExpFile, geneCol=1, valCol=c(7,9,12,15,18,8,10,11,13,16))
exp[30:35,]
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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 16:27:12
