getConnectedComponentList(DEGraph)
getConnectedComponentList()所属R语言包:DEGraph
Given a graph, returns a list of its connected components (which are also graph objects), ordered by decreasing number of
鉴于图形,返回其连接组件(这也是图形对象)的列表,通过减少数量排序
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a graph, returns a list of its connected components (which are also graph objects), ordered by decreasing number of nodes.
给定一个图,返回一个连接组件(这也是图形对象),通过减少节点数量排序,列表。
用法----------Usage----------
getConnectedComponentList(graph, verbose=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:graph
A graph object.
一个graph对象。
参数:verbose
If TRUE, extra information is output.
如果TRUE,输出额外的信息。
值----------Value----------
A list containing a graph object for each connected component of the input graph, ordered by decreasing number of nodes
一个listgraph对象包含输入图中的每个连接组件,通过减少节点数量排序
作者(S)----------Author(s)----------
Laurent Jacob, Pierre Neuvial and Sandrine Dudoit
参见----------See Also----------
connectedComp.
connectedComp。
举例----------Examples----------
data("Loi2008_DEGraphVignette")
exprData <- exprLoi2008
rn <- rownames(exprData)
## Retrieve expression levels data for genes from one KEGG pathway[#从一个KEGG通路的基因表达水平的数据检索]
graph <- grListKEGG[[1]]
pname <- attr(graph, "label")
cat(verbose, "Pathway name: ", pname)
sgraph <- getSignedGraph(graph, verbose=TRUE)
print(sgraph)
graphList <- getConnectedComponentList(graph, verbose=TRUE)
print(graphList)
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注:
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