R语言 DEGraph包 exprLoi2008()函数中文帮助文档(中英文对照)

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exprLoi2008(DEGraph)
exprLoi2008()所属R语言包：DEGraph

                                        Gene expression data used in the DEGraph package vignette
                                         基因表达在数据使用的DEGraph包小插曲

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set gives gene expression data for a subset of 227 genes used in the DEGraph package vignette. This comes from the 15737 gene, 255 patient dataset of Loi et al. (2008) which was used to study resistance to tamoxifen treatment in hormone-dependent breast cancer.
这组数据给出了基因表达数据中使用的DEGraph包小插曲227基因的一个子集。这是来自15737的基因，宝来等255个病人集。 （2008年），它是用来研究他莫昔芬治疗激素依赖型乳腺癌的阻力。


用法----------Usage----------


exprLoi2008



格式----------Format----------

A matrix of 227 lines and 255 columns.
227线和255列的矩阵。


Details

详情----------Details----------

The original data set corresponds to data processed by RMA and median-centered as available from the GSE6532 GEO archive: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE6532.
原始数据集对应的数据处理RMA和GSE6532GEO归档为中心的中位数：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE6532。

These data were summarized from the probe set level to the gene level as  follows. The expression level of a gene was defined as the expression level  of the probe set with largest alignment score among all probe sets mapping  to this gene according to the annotation in GSE6532. When the largest  alignment score was achieved by several probe sets, the median expression  level of those probe sets was taken.
这些数据进行了总结如下基因探针组水平。设置探针与各探针最大比对得分中国，设置根据的GSE6532注释，映射到这个基因的表达水平被定义为一个基因的表达水平。当几个探针组取得的最大对齐得分，采取这些探针集的平均表达水平。


作者（S）----------Author(s)----------


Laurent Jacob, Pierre Neuvial and Sandrine Dudoit



源----------Source----------

Loi et al., Predicting prognosis using molecular profiling in estrogen receptor-positive breast cancer treated with tamoxifen.
莱等，使用雌激素受体阳性乳腺癌与他莫昔芬治疗癌症的分子分析预测预后。


参考文献----------References----------

Predicting prognosis using molecular profiling in estrogen receptor-positive breast cancer treated with tamoxifen. BMC Genomics, 9(1):239, 2008.

举例----------Examples----------


data("Loi2008_DEGraphVignette")

dim(exprLoi2008)
head(exprLoi2008)

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