R语言 DEDS包 affySpikeIn()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

affySpikeIn(DEDS)
affySpikeIn()所属R语言包：DEDS

                                        Gene expression dataset from Affymetrix Spike-in Experiments
                                         从Affymetrix公司的基因表达数据集穗在实验

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The spike-in experiment represents a portion of the data used by Affymetrix to develop their MAS 5.0 preprocessing algorithm.  Here we utilize the RMA (Irizarry et. al) probe level summaries.  The data features 14  human genes spiked-in at a series of 14 known concentrations  (0, 2^{-2}, 2^{-1}, …, 2^{10} pM) according to  a Latin square design among 12612 null genes.  The data matrix affySpikeIn represents the two array groups among the 14 array groups that contain 12 replicates. Further details are available
穗在实验部分由Affymetrix用于开发他们的MAS 5.0预处理算法的数据。在这里，我们利用的RMA（Irizarry等人）探测水平总结。数据具有一系列14个已知浓度（0, 2^{-2}, 2^{-1}, …, 2^{10}下午）飙升14人类基因按拉丁方设计在12612空基因。数据矩阵affySpikeIn代表两个群体之间的14个阵列组包含12复制数组。提供进一步的细节


用法----------Usage----------


data(affySpikeIn)



值----------Value----------


参数：affySpikeIn
matrix of gene expression levels measurements, rows correspond to genes (12626 genes) and columns to 24 samples.
基因表达水平的测量矩阵，行对应的基因（12626个基因）和24个样本的列。


参数：affySpikeIn.L
numeric vector indicating the sample class, 12 (code 0) vs. 12 (code 1).
数字矢量显示的示例类，12（代码0） -  12（代码1）。


参数：affySpikeIn.gnames
character vector containing the names of the 12626 genes.
特征向量包含的12626个基因的名称。


参数：spikedgene
numeric vector given the location of the 14 spiked genes.
数字矢量14尖刺基因的位置。


参考文献----------References----------

T. P. Speed (2003) Summeries of affymetrix genechip probe level data.
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。